V roku 1971 došlo v jeho živote k rozhodujúcej skúsenosti, keď na duchovných cvičeniach zažil „vyliatie Ducha Svätého“. Po tomto stretnutí spolu s Martine Laffitte založil modlitebnú skupinu, ktorá za rok dosiahla 500 účastníkov. V roku 1973 sa tieto modlitebné skupiny, ktoré nazval „Emanuel“, v meste Paríž rýchlo rozrástli a začali sa pre nich organizovať letné stretnutia v Sanktuáriu Najsvätejšieho Srdca Ježišovho v Paray-le-Monial. Miestny biskup zveril starostlivosť o túto svätyňu komunite Emanuel, čím sa stala významným centrom spirituality. V roku 1978 sa vrátil bývať na obytnú loď, ktorá sa stala akýmsi „ústredím“ Komunity Emanuel, ktorá sa ďalej rozrastala a rýchlo expandovala v mnohých krajinách (v súčasnosti je prítomná v 70 krajinách na rôznych kontinentoch). Po infarkte, ktorý utrpel v lete 1985, sa rozhodol odísť z úlohy moderátora Komunity Emanuel a strávil poslednú časť svojho života v úkryte a v modlitbe, v postoji úplného odovzdania sa Bohu. Zomrel na Péniche 25. marca 1991 a jeho pohreb o dva dni neskôr, na Zelený štvrtok, slávil parížsky arcibiskup kardinál Jean-Marie Lustiger v kostole Najsvätejšej Trojice, ktorý bol zverený do starostlivosti Komunity Emanuel.